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液相色谱仪从流动相瓶到废液瓶之间的流路是一个全封闭体系，内部压力很高，但外部却能保证一滴不漏。如果某个部件发生漏液，那就出现故障了。漏液的原因分两种：
（1） 接触硬件不当
在更换零件如流路管或换柱时，换的接头接口不匹配，造成漏液。要注意不同公司的柱子接头很多是不同的，甚至同一家公司在不同时期生产的液相柱接头也有很大区别。当然选用PEEK接头是一种较好的解决方法，不仅通用性好，而且靠手拧就能保证不漏液。即使接口本身匹配，若操作不当也会漏液，一种不当是力度把握不好，拧得太紧或太松；另一种不当是滑丝，这往往是动手能力不强，螺丝钉很少拧的工作者所犯的错误，滑丝的后果不仅是漏液那么简单，常造成重要部件的报废。解决这个问题只能提高拧螺丝的基本功。
（2）使用仪器不当
用缓冲液盐溶液(不论甲醇含量有多少)作流动相时，实验结束后没有换甲醇水冲洗，使得微渗的流动相干燥形成晶体。不过输送泵漏液不一定非得马上修，冲洗干净并在以后的使用中多加小心一般可以正常使用。检测器漏液是个很麻烦的事，一般是吸收池的问题，更换费用很高。若能凑合使用，不一定马上更换。
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