抗体的蛋白质检测存在一些缺点，抗体的可用性和质量差别很大。通过分析人类蛋白靶标有关的抗体的系统生发和特征，来寻找解决这些问题的方法。一种称为三重四极杆质谱仪(triple quadrupole)技术的质谱方法能检测到独一无二的特异性肽段，帮助研究人员高灵敏度，可重复性的定量监测这些蛋白。定向蛋白质组的核心是利用串联四级杆质谱特有的MRM扫描方式来定向检测蛋白质，通过软件计算要检测蛋白质的肽对应的母子离子对，用串联四级杆质谱进行MRM扫描，得到MRM色谱峰，一般还会进行MSMS扫描，以对这些肽的MRM进行序列确认，或利用 MSMS进行定性和翻译后修饰位点检测等。PRM靶向蛋白质组，是一种基于高分辨、高精度质谱的靶向定量技术，其基本原理是：四级杆（Q）首先选出的目标肽段离子，进入碰撞室中打碎后，所有的碎片离子经过质量分析器产生一张高分辨的二级质谱图，通过提取其中的碎片离子信息即可实现目标肽段的定量。能够对目标蛋白质/肽段（以及含有修饰的肽段）进行选择性检测，靶向蛋白质组扫描就像精准狙击，排除干扰，目标明确，每一枪直指目标。从而实现对目标蛋白质/肽段的精准定量。靶向蛋白质组扫描就像精准狙击，排除干扰，目标明确，每一枪直指目标。