DNA纯化是分子生物学研究中经常需要用到的一种方法。一般来说,做DNA纯化有3个目 的:1.获得高纯度的DNA; 2,浓缩DNA; 3,用DNA做测序。
DNA纯化实验基本上可以分为PCR清洁试剂盒纯化法和DNA凝胶回收纯化法两大类。PCR 清洁试剂盒纯化法又称为硅胶膜吸附法。因为它的原理是:硅胶膜可在高盐条件下结合DNA, 又可在低盐条件下与DNA分离。而DNA溶液中的其他渣渣包括引物、单核苷酸、酶、矿物 油、盐离子等,因为没有DNA的这种神特性,所以会被分离开来。
如果你的PCR产物得到的是单一条带,完全可以直接纯化。那么问题来了。如果发现有杂带?怎么办?有哪些办法可以提取得更干净?
那么就诞生了我们的第二种方法:DNA凝胶回收纯化法。这种方法简单粗暴有效率,也能纯化得比较彻底。现在已经慢慢地取代了第一种方法,成为了DNA纯化的主流方法。
扩增时岀现非特异性条带,那么在胶回收时切胶很重要,切胶时尽量选择目的基因条带,可以将目的基因所在的胶的边缘弃去一些,尽量不要切上含有非特异性带的胶。切胶之后就是回收了。这里就要讲到毛博的独门protocol 市售的试剂盒常常有小片断回收效率很低的问题。其实完全没有必要买试剂盒。回收可以用酚氯仿。PCR产物经过酶切、回收等步骤后,损失太大。我的做法是:简化步骤、减少核酸在处理过程中的损失,让较多量的PCR产物和质粒片断进入酶连反应一一以量取胜。
大致的做法是:制作100RL PCR产物;酒精沉淀回收PCR产物;PCR产物及载体酶切;跑回收胶;将回收胶上的PCR产物和载体片断切下,回收到一个试管中;冰冻、碎胶,酚、氯仿抽提,酒精沉淀;加入8微升水、1微升连接酶和1微升连接buffer,4度过夜;转化涂板。