EB染料
在研究数以千计的实验室残留性有毒物质,最值得一提的就是漠化乙锭(EB, 3, 8-二氨基-5- 乙基-6-phenylphenanthridinium甲基溴),该物质的潜在毒性作用已被大众广泛的认知。EB属于核酸分子嵌入剂,通常用于分子遗传学、DNA和染色质结构分析等研究中,特别是国内很多实验室仍在使用EB进行凝胶核酸电泳实验的染色。
EB是极易渗透细胞膜与胞内DNA嵌合的小分子,它具有平面共轭大环结构,是典型的DNA 分子插入试剂,菲啶环插入到DNA分子的碱基对之间,与DNA嵌合形成稳定的复合物,并影响DNA的复制,破坏正常的遗传生理现象。EB作为诱变性的化合物,它在人体中诱导突变的机制是不可逆转的。
GoldView 染料
GoldView(GV)是一种可代替漠化乙锭(EB)的新型核酸染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,也可用于RNA染色。Goldview 对于大片段DNA的染色效果还凑合,但是在对于500bp以下的片段效果不是很好,还有一个弱点是它的荧光基团在紫外灯下非常容易淬灭,一般5-10min条带就会消失。所以应该抓紧时间拍照后再观察。
实质上,所谓的Goldview就是吖啶橙,也就是传说中的AO,有一种传统的细胞凋亡试验, 采用的染料正是吖啶橙,也就是AO/EB染色试验,EB无法穿透完整的细胞膜,而AO可以穿过细胞膜染上细胞核,以此来区分凋亡和未凋亡的细胞。这个实验其实告诉我们的是,由于AO会穿过细胞膜,所以虽然GoldView被说的多么不具有毒性,我们还是要谨慎待之。
GelRed 和 GelGreen 染料
GelRed和GelGreen是两种集高灵敏、低毒性和超稳定于一身的极佳的荧光核酸凝胶染色试剂。其水溶染色剂通过美国环保局安全认定,废弃物可直接倒入下水道,而不会造成任何环境污染。GelRed和GelGreen的特殊化学结构使其难以穿透细胞膜进入细胞,正是这一特性降低了染料的细胞毒性。不过也正是因为如此,其价格大约是GoldView的十倍左右。