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RNA抽提需要注意哪些事项才不容易降解?

天边-会员头像-www.biaowu.com北纳生物
天边 2021-12-13 15:58 评论( 0 ) 浏览( 1494 )
外源酶会造成RNA的降解,造成RNA得率太低,或者彻底失败。而外源酶又是无处不在的。 这就要求注意以下三点: 注意一:严格戴好口罩,手套。手指和呼吸时重要的外源酶的来源。所以做RNA抽提的时候,还是要全副武装起来。这对自己也是一种保护措施。 注意二:实验所涉及的离心管,枪头,移液器,实验台面等要彻底处理。离心管和枪头要用 DEPC处理过,单纯的消毒灭菌可不行呀。移液器和实验台面等要用75%的酒精擦过。 注意三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保RNase-Free。 注意四:选择合适的匀浆方法。新鲜样品取材后应立即置于液氮中速冻,然后可以移至-70°C冰箱保存。在碾磨前,碾磨用具也必须预冷。在碾磨过程中,一边碾磨,一边补充液氮。样品碾碎后,在液氮刚刚挥发完时,将样品迅速转移到含裂解液的容器中,立即混匀匀浆。 注意五:选择合适的裂解液。现在市场上常用的裂解液几乎都能抑制Rnase活性。但是, 高内源酶含量的样品,如肝脏,脾脏等组织,建议使用含苯酚的裂解液。苯酚的灭活内源酶的能力是很强的。 注意六:控制好样品的起始量。如果样品的块头太大,所有的细胞无法迅速和裂解液接触。 里面没有接触到细胞的RNA很快就会被内源酶降解。所以,起始量不要太大。如果块头太 大,要把它切成小块小块的。 注意七:任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。所以,要进行样 品的破碎和匀浆。其目的是为了使RNA彻底地完整地释放出来。如果样品是细胞,则无须破碎即可直接匀浆;如果是组织,甚至器官,那就需要破碎后才能匀浆;如果是酵母菌和细 菌,则需要先用相应的酶破壁后才能匀浆。 注意八:RNA抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成功,而不是得率。我们为什么 要抽提RNA?是为了后面的实验,例如原位杂交,免疫沉淀等等。所以,一定要明确后面到底是要干嘛? cDNA文库构建要求RNA完整而无酶反应抑制物残留;Northern对RNA完 整性要求较高,对酶反应抑制物残留要求较低;RT-PCR对RNA完整性要求不太高,但对酶 反应抑制物残留要求严格。不用每次都以获得最高纯度的RNA为目的,从而造成不必要的浪费。
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