miRNA的命名规则（以动物miRNA为例） 一般，pre-miRNA以“mir”命名，其编号以“MI”编号,如人的miRNA 122的前体ID为hsa-mir- 122, Accession为MI0000442；而miRNA的成熟链以“miR”命名，其编号以“MIMAT”编号，如人的 miR-122 的一个成熟体的 ID 为 hsa-miR-122-5p，Accession 为 MIMAT0000421。其中，在确定命名规则之前发现的miRNA,依然保留原来名字，如hsa-let-7。miRNA后的阿拉伯数字表明被发现的先后顺序，如hsa-miR-122；尽管曾经还用表明表达量低的miRNA， 但现在这种命名方式已被取消。 此外，病毒miRNA的命名方式与动物相一致，但是植物的却有些与众不同。通常植物的Pre-miRNA 以 MIR 命名，如 ath-MIR156a； miRNA 则以 miR 来命名，如 ath-miR156a。注意： MIR/miR与命名顺序之间没有“-" 实际上，目前lncRNA的命名还没有一个统一的原则，但为了让lncRNA的命名具有唯一性、 准确性并最大程度上反映其功能，雨果基因命名委员会（HGNC，唯一的制定人类基因命名 标准的官方授权机构）提供了一个命名指导指南，以供参考。 首先，每条lncRNA的名字应具有唯一性，不能发生一个基因几个名字或存在重名的现象。 因而，作者在发表新lncRNA时，可先获取HGNC的认可，如果作者发布的名字已在其他地 方使用过，HGNC将会指定一个新名字供作者选择。 IncRNA的名字应是描述基因的缩写，便于人们理解名字的含义。如BANCR就是BRAF- activatednon-proteincoding RNA 的缩写。 IncRNA的名字应仅由拉丁字母和阿拉伯数字组成，不应出现标点符号。连字符仅在特殊场 合使用，如：反义编码蛋白基因可在标识中加连字符（BACE1-AS就是BACE1 antisense RNA 的名字）。 lncRNA的名字中的字母应为大写，为了与其它种类物种的基因区别开来（如啮齿动物基因 的标识只要求首字母大写，其余小写），人类基因标识中的字母都应为大写，例如HOTAIR基 因，在人类中叫HOTAIR，而在老鼠中写成Hotair。 lncRNA的名字中不应涉及具体的物种类型，例如：如果基因名字中有H/h（代表人类），由 于牵涉到同源基因的问题，就会造成一些疑惑和误导。 lncRNA的命名应避免采用一些常用的词汇，否则会给分析研究带来很多问题，比如：“AIRN” 基因最初公布时叫“AIR”,从公共数据库中搜索可得到22万条不相关的信息，而搜索“AIRN” 则只有10条信息。 lncRNA的命名应尽可能的反映其功能，如XIST基因是“X（inactive）-specific transcript”的缩写， 该基因的作用是参与沉默一对X染色体的转录。命名的时候尽量反映基因通常的功能，而不 体现其突变表型。其命名应简洁明了，不应包含以下信息： *具有攻击或轻蔑的色彩。 *具有个人及地方色彩。 *含有神化，虚构或历史人物的名字。 *含有“臆想”和没什么意义的信息。 功能性转录假基因在命名时应保留它们假基因名称且不应改变其基于功能的名称。为了方便 搜索，这个功能应加在名字的最后。eg: PTENP1是“phosphatase and tensin homolog pseudogene 1 （functional）”. 而对于未知功能的IncRNA应依据基因组上下文来命名，下图则给出了系统化的命名的规则。