SOE PCR是一种通过寡聚合甘酸链之间重叠的部分互相搭桥、互为模板进行PCR扩增,从而获得目的DNA基因片段的方法。SOE PCR可简单地凭借互补引物,通过PCR迅速地将两段基因连接在一起,成为新的杂交基因片段。
比如要将基因A和B连接在一起,假设引物P1, P2扩增基因片段A,引物P3、P4扩增基因片段B;P2、P3为内引物,P2上含有B的序列,P3上含有A片段的互补序列。单独PCR后, P1、P2将A的3'端带有B的5'端的互补序列,P3、P4将B的5'端带有B的3'端的互补序列;将各自PCR产物混合作为模板,变性退火后,A链和B链结合起来,延伸成新的杂交基因,可以将A、B连接起来。