质粒抽提通常用的是碱裂解法，一般的试剂盒都会有SolutionI，Solution II，Solutionlll，有的还会有SolutionIV，然后是过柱子。 — Solution I一般都是用来重悬菌液的，会加入RNase I,溶解掉里面大肠杆菌的RNA。 同时里面还会用Tris-HCl体糸来维持一个 pH,另外会加入较大量的EDTA,去螯合掉里面二价金属离子，使菌体本身的DNase现形。 Solution II,—般来说主要成分有两个,就是NaOH和SDS, NaOH要是用于破坏细胞膜结构。而SDS在这里主要并不是起列裂解菌体的作用，而是结合氨基酸，一般两个氨基酸可以结合一个SDS分子。菌体裂解后，小片段的质粒已经释放出来了，大片段的基因组DNA还结合在蛋白质上。 Solutionlll的主要成分是醋酸钾/醋酸缓冲液。首先长时间强碱环境下，DNA会断裂，所以需要用醋酸进行中和，而钾离子可以与SDS产生沉淀反应，使可溶于于水的十二烷基磺酸钠变成不溶于水的十二烷基磺酸钾。这样结合蛋向质的PDS就被沉淀下来了，同样基因组DNA也同时沉淀下来，用硅胶吸附释放在上清里的质粒,或者用无水乙醇对上清进行沉淀，即可获得质粒的DNA。 基因组DNA提取 而普通的基因组DNA抽提，首先是裂解，用离子型的蛋白变性剂：CTAB或者SDS对细胞进行裂解（加不加蛋白酶K其实并不太要紧），破膜的同时使得DNA从蛋白上解离下来。 加入高盐溶液使蛋白质沉淀。然后用酚仿，使蛋白质沉淀变性在水相油相间，并分离出的可溶性蛋白。上清用异丙醇将DNA沉淀下来，同时低温加入一定量的一价阳离子，可加速DNA沉淀。这些能和上述的质粒抽提混为一谈么？！当然不行啊！ 小伙伴们现在能明白为啥基因组DNA不能用质粒抽提的试剂了吧。